В апреле климат в Томбукту можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в апреле 38 градусов тепла. В среднем в апреле в Томбукту 27 ясных и 3 дня с переменной облачностью. В апреле, а также в мае, июне, июле и августе Томбукту cчитается местом, некомфортным для посещения.