В сентябре климат в Зонтхофене можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 14 градусов тепла. В среднем в сентябре в Зонтхофене 14 дождливых, 10 ясных и 6 дней с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные.