В мае климат в Скагуэе можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в мае 7 градусов тепла. В среднем в мае в Скагуэе 10 дождливых, 8 пасмурных, 7 с переменной облачностью и 6 ясных дней. Дожди преимущественно сильные. В мае, а также в июне, июле, августе и сентябре Скагуэй cчитается местом, некомфортным для посещения.