В мае климат в Сан-Томе можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в мае 27 градусов тепла. В среднем в мае в Сан-Томе 14 пасмурных, 13 дождливых и 4 ясных дня. Дожди преимущественно сильные.