В сентябре климат в Сан Мартин де Лос Андес можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 5 градусов тепла. В среднем в сентябре в Сан Мартин де Лос Андес 15 дождливых, 7 ясных, 5 пасмурных и 3 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в мае, июне, июле и августе Сан Мартин де Лос Андес cчитается местом, некомфортным для посещения.