Сентябрь в Рио-Сан-Хуан — самый жаркий месяц в году. В сентябре климат в Рио-Сан-Хуан можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в сентябре 29 градусов тепла. В среднем в сентябре в Рио-Сан-Хуан 19 дождливых и 11 ясных дней. Дожди преимущественно сильные. В сентябре, а также в мае, июне, июле и августе Рио-Сан-Хуан cчитается местом, некомфортным для посещения.