В сентябре климат в Пристани-Второй можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 14 градусов тепла. В среднем в сентябре в Пристани-Второй 13 дождливых, 9 с переменной облачностью, 6 ясных и 2 пасмурных дня. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, апреле и октябре Пристань-Вторая cчитается местом, некомфортным для посещения.