В июне климат в Нешкан можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в июне 8 градусов тепла. В среднем в июне в Нешкан 15 пасмурных, 8 с переменной облачностью, 5 ясных и 2 дождливых дня. Дожди преимущественно слабые.