В сентябре климат в Мокоа можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 22 градуса тепла. В среднем в сентябре в Мокоа 12 пасмурных, 11 с переменной облачностью, 6 ясных и дождливый день. Дожди преимущественно слабые. В сентябре, а также в январе и августе Мокоа cчитается местом, комфортным для посещения.