В июне климат в Мерса-Матрухе можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 25 градусов тепла. В среднем в июне в Мерса-Матрухе 30 ясных дней. В июне, а также в мае и октябре Мерса-Матрух cчитается местом, комфортным для посещения.