В сентябре климат в Маркаколе можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 17 градусов тепла. В среднем в сентябре в Маркаколе 25 ясных, 3 с переменной облачностью и 2 дождливых дня. Дожди преимущественно слабые.