В сентябре климат в Малом Ситно можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 15 градусов тепла. В среднем в сентябре в Малом Ситно 10 дождливых, 8 с переменной облачностью, 7 ясных и 5 пасмурных дней. Дожди преимущественно слабые.