В сентябре климат в Малом Щербедине можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 18 градусов тепла. В среднем в сентябре в Малом Щербедине 14 дней с переменной облачностью, 10 ясных, 5 дождливых и 1 пасмурный день. Дожди преимущественно умеренные.