В июне климат в Кызылтане можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 25 градусов тепла. В среднем в июне в Кызылтане 13 дней с переменной облачностью, 12 ясных и 5 дождливых дней. Дожди преимущественно умеренные.