В сентябре климат в Кызылсая можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 15 градусов тепла. В среднем в сентябре в Кызылсая 9 дней с переменной облачностью, 8 ясных, 8 пасмурных и 5 дождливых дней. Дожди преимущественно слабые.