Сентябрь в Кууджуарапике — самый дождливый месяц в году. В сентябре климат в Кууджуарапике можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 10 градусов тепла. В среднем в сентябре в Кууджуарапике 17 дождливых, 7 с переменной облачностью, 3 ясных и 3 пасмурных дня. Дожди преимущественно сильные. В сентябре, а также в январе, феврале, марте и июне Кууджуарапик cчитается местом, некомфортным для посещения.