В сентябре климат в Котласе можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 11 градусов тепла. В среднем в сентябре в Котласе 14 дождливых, 14 пасмурных и 2 ясных дня. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, апреле и октябре Котлас cчитается местом, некомфортным для посещения.