В сентябре климат в Костомукше можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 11 градусов тепла. В среднем в сентябре в Костомукше 13 дождливых, 7 с переменной облачностью, 6 пасмурных и 4 ясных дня. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, апреле и мае Костомукша cчитается местом, некомфортным для посещения.