Сентябрь в Кисангани — самый пасмурный месяц в году. В сентябре климат в Кисангани можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в сентябре 28 градусов тепла. В среднем в сентябре в Кисангани 26 дождливых, 2 пасмурных и 2 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные. В сентябре, а также в марте, апреле, мае и июне Кисангани cчитается местом, некомфортным для посещения.