В сентябре климат в Каратогае можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 21 градус тепла. В среднем в сентябре в Каратогае 26 ясных, 3 с переменной облачностью и 1 пасмурный день. В сентябре, а также в мае Каратогай cчитается местом, комфортным для посещения.