В июне климат в Джубе можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в июне 29 градусов тепла. В среднем в июне в Джубе 28 дождливых и 2 ясных дня. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в мае, июле, августе и сентябре Джуба cчитается местом, некомфортным для посещения.