Июнь в Генерал-Сантосе — самый дождливый и пасмурный месяц в году. В июне климат в Генерал-Сантосе можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 26 градусов тепла. В среднем в июне в Генерал-Сантосе 30 дождливых дней. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в январе, феврале, марте и апреле Генерал-Сантос cчитается местом, некомфортным для посещения.