В сентябре климат в Кагаян-де-Оро можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в сентябре 28 градусов тепла. В среднем в сентябре в Кагаян-де-Оро 22 дождливых и 8 пасмурных дней. Дожди преимущественно сильные. В сентябре, а также в январе, мае, июне и июле Кагаян-де-Оро cчитается местом, некомфортным для посещения.