Июнь в Ботуобуйинском наслеге — самый дождливый и солнечный месяц в году. В июне климат в Ботуобуйинском наслеге можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 20 градусов тепла. В среднем в июне в Ботуобуйинском наслеге 10 дождливых, 8 ясных, 8 с переменной облачностью и 4 пасмурных дня. Дожди преимущественно умеренные.