В сентябре климат в Боготоле можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 13 градусов тепла. В среднем в сентябре в Боготоле 13 дождливых, 9 с переменной облачностью, 5 пасмурных и 3 ясных дня. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, октябре и декабре Боготол cчитается местом, некомфортным для посещения.