В сентябре климат в Бейкер-Лейк можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 7 градусов тепла. В среднем в сентябре в Бейкер-Лейк 14 пасмурных, 8 дождливых, 6 с переменной облачностью и 2 ясных дня. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, марте и апреле Бейкер-Лейк cчитается местом, некомфортным для посещения.