В сентябре климат в Амдерме можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 7 градусов тепла. В среднем в сентябре в Амдерме 15 пасмурных, 11 дождливых, 3 ясных и 1 день с переменной облачностью. Дожди преимущественно слабые. В сентябре, а также в январе, феврале, марте и июне Амдерма cчитается местом, некомфортным для посещения.