Я смотрю что это опять очередная компания, которая строит объекты от которых кровь течет из глаз. Комментарии удаляют, поэтому оставлю тут.
открою секрет. Не важно что у вас написано про "пени" в договоре. У нас есть гражданский кодекс в котором все написано. За каждый день просрочки по договору подряда по вине подрядчика, подрядчик обязан выплатить 3% цены договора. Максимальная сумма ограничивается ценой договора и не может ее превышать. И если в договоре прописано например что подрядчик выплачивает за день просрочки 0,1% и не более 1000000р, можете смело идти в суд и без вариантов вы выиграете, потому что такие пункты договора ущемляют ваши законные права. Суд конечно уменьшит сумму выплаты, потому что сумма ущерба должна быть соразмерна действительному ущербу, ну скажем допустим имеется договор на 10 лимонов, подрядчик достроил дом но задержал конечный срок на 100 дней. Правильный расчет в этом случае 0.03 * 100 * 10 000 000 = 30 000 000р, но учитывая что максимальный размер не может превышать цену договора, с подрядчика можно взызскивать 10 000 000р. Когда пойдете в суд, суд согласится с этим, но снизит эту сумму процентов на 50-70. Но сначала нужно конечно в досудебном порядке попробовать решить проблему в любом случае. Если они нормально себя ведут, ищите компромис, если начинают вас кошмарить, после досудебки идите в суд